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从上世纪建院初期，文登整骨医院就为提高疗效而自发试验，他们选择两组病人对照，用鸡爪接骨药代替了虎骨配合发汗的方法，从而把住院病人费用人均84元降至26元，将医护人员从烧炕发汗的劳动中解脱出来。初次试验的成功，提高了全院士气，掀起技术革新高潮。
改革开放以来，历任院领导更是清醒地认识到，要想跨上新台阶，必须在孙氏整骨的基础上，把眼睛盯在国内外先进整骨技术上，树立“科技兴院”的办院思路。多年来，医院加大投资力度，搭建创新平台，学术空气活跃，1986年以来，特别是2000年至今，医院领导坚持自主创新，走中医骨伤科学现代化道路，使医院进入科研成果高产期，成绩显著。
课题来源于临床，科研促进临床。在全院浓郁的科研氛围中，他们认真探讨中医典籍，结合解剖学、生物力学，广泛开展骨伤治疗新技术，坚持走“临床和科研相结合”的道路。如脊柱脊髓科成功研制的“充气式弹性脊柱固定牵引器”治疗胸腰段脊柱骨折、“单钉-沟槽柱翼钢板”治疗腰椎滑脱症等，较好地解决了临床疑难病症，形成文登特色。
医院自行研制的脊柱系列产品中，价格均为进口同类产品的1/10至1/20，而临床应用效果大大优于进口同类产品，为病人节约了大量的医疗费用支出，仅此一项，每年至少在800万元以上。
为鼓励全院医务人员科研积极性，医院每年用于智力投资的经费达60～100万元，制定了一系列科技奖励办法，如科研立项课题的一切启动经费由医院支付，公开发表学术论文的版面费医院全部报销，科研成果获奖者医院给予奖励，医院每年都拿出业务收入结余的6%作为科研经费等等。近年来，医院先后投资300余万元，新建了细胞实验室、生物力学实验室、中药实验室、动物实验室，先后建立了电子图书馆、期刊全文数据库、远程会诊中心，建立了影像、检验、病历等信息的智能化共享系统。
卓越的科研成果，筑起文登整骨医院的高楼大厦。目前共取得省级以上科研成果37项次，其中国家科技发明三等奖、国家科技进步二等奖、三等奖各1项；国家中医药管理局科技进步一等奖1项，二等奖5项，三等奖2项；山东省科技进步一等奖1项，二等奖18项，三等奖6项。
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